minix
最老的、認為也是最可靠的，但性能上是很有限的（有時沒有標志，文件名最多 30 個字符）並且容量也是有限的（每個這樣的文件系統最多 64MB）。
xia
一個 minix 文件系統的修正版本，降低了對文件名長度以及文件系統大小的限制，但並沒有引進新的特性。它並不流行，但據報道工作的很好。
ext2
非常有特色的出自於 Linux 的文件系統，也是當今最流行的文件系統。它被設計成易於升級的，這樣文件系統代碼的新版本就不需要重建已存在的文件系統。
ext
是 ext2 的老版本，不是向上兼容的。已不再在安裝中使用了，並且大多數人都已轉換到了 ext2。
另外，還支持一些外來的文件系統，使得與其他操作系統交換文件變得更容易了。這些外來的文件系統工作起來如同本地的一樣，只是它們缺乏一些通常的 UNIX 的特征，或者有著奇特的限制或其它古怪的地方。
msdos
與 MS-DOS 的（以及 OS/2 和 Windows NT） FAT 文件系統兼容。
usmdos
是在 Linux 下對 msdos 文件系統的擴展，支持長文件名、所有者、權限、連接以及設備文件。這使得一個常規的 msdos 文件系統能夠想 Linux 的文件系統一樣的使用，因此對Linux來說也就無需一個獨立的分區了。
Iso9660
標准的 CD-ROM 文件系統；自動支持允許更長文件名的 Rock Ridge 擴展文件系統。它是對標准 CD-ROM 文件系統的擴展。
nfs
一個網絡文件系統，允許在許多計算機之間共享一個文件系統，易於這些計算機對文件的訪問。
hpfs
OS/2 的文件系統。
sysv
SystemV/386,以及 Xenix 文件系統。
要依具體情況來選擇使用文件系統。如果兼容性或其它原因使得需要使用一個非原始的文件系統，那就必須使用其中的一個。如果能自由地選用文件系統的話，那麼選用 ext2 也許是最明知的，因為它有所有的特征並且沒有性能上的下降。
還有一種 proc 文件系統，通常作為 /proc 目錄來訪問，它其實完全不是一個真正的文件系統，盡管看起來它很象。proc 文件系統使得訪問某些內核的數據結構變得很容易，如進程列表（因此還有名字）。它使得這些數據結構看起來很象是一個文件系統，並且能夠使用所有通常的文件工具來操作處理。例如，要取得所有進程的一個列表，可以使用命令。
