ATAPI MO在Linux操作系統上使用前一般需要對LINUX系統內核作一點修改，然後重新編譯LINUX系統內核。
另外，Linux操作系統內核版本小於2.2.2時可能不支持ATAPI MO，因此要在Linux上使用ATAPI MO時，請安裝內核版本不小於2.2.2的操作系統。或者在原來低版本的基礎上進行升級。
ATAPI MO在Linux操作系統上安裝大致分以下幾個過程：
（1） 確認Linux OS內核版本
由於Linux OS內核版本小於2.2.2時可能不支持ATAPI MO，因此對使用內核版本小於2.2.2的Linux OS，首先要取得Kernel-2.2.2以上的版本，將之解壓到"/usr/src"目錄下。
對使用2.2.2以上內核版本的Linux OS，不須此步驟。
（2）配置Linux OS內核
當升級或確認Linux OS內核版本後，接下來要重新配置Linux的內核。進入"/usr/src/linux"目錄，運行"# make config"或"make menUConfig"命令，在出現一連串的選擇提示或菜單，將下面兩部分修改為"yes":
"Enhenced IDE/MFM/RLL disk/cdrom/tape/floppy support"
"SCSIemulation support"
修改完後，將配置文件存盤。
（3）重新編譯內核
（4）用新內核重新啟動計算機。
詳細編譯內核的過程請參看有關LINUX資料。
需要提醒的是：在用新內核前，最好將原來的內核備份，以防出現新內核工作不正常導致系統癱瘓。
LINUX系統下ATAPI MO支持128M--1300M的所有MO盤片。
Linux環境下SCSI接口MO的使用方法
SCSI接口的MO在Linux操作系統下，當SCSI適配器正確安裝後，MO就可以當成一個SCSI磁盤使用，Linux系統支持所有512字節/扇區和2048字節/扇區的MO盤片。
mount MO後，Linux系統可將540M、230M、128M的盤片分區、格式化成FAT或ext2文件系統格式，640M和1300M的盤片能分區、格式化ext2格式，但不能為FAT格式，這與每扇區2048字節有關。
當安裝Linux系統沒有安裝SCSI適配器驅動時，可在Linux安裝後再另行安裝，但系統必須支持這種SCSI型號。一種較簡單的安裝方法如下：
（1）在/etc/conf.modules中加入一行：alias scsi_hostadapter ncr53c8xx (假設SCSI卡型號為ncr53c8xx)
（2）運行命令行：insmod /lib/modules/2.2.10/scsi/ncr53c8xx.o (2.2.10為對應Linux系統內核版本號，不同版本會不一樣)。
經過以上兩步後，就可正確mount SCSI MO了。
