以前很多公司是以搞Linux發行版本來進入Linux領域的，但現在進入Linux領域最好是搞Linux的應用。如著名系統集成和軟件開發服務商中聯在線信息發展有限公司和東方經濟發展總公司就是通過向Linux應用開發商投資而進入Linux的。Linux是開放源代碼，也有很多開放源代碼的應用程序。按GPL規則，人們在開放源代碼的軟件上再改進也應遵循GPL，但在Linux上自己重新開發的應用軟件卻不一定要按GPL規則。開發的應用程序是有版權的，可以以較高的價格出售。當然人們也可以公開源代碼，接受GPL規則。我們希望有更多的軟件開發商在Linux上開發出更多、更好的應用軟件。當然也可以用Java編寫應用軟件，這樣既可以在Linux上運行，也可以在Windows上運行。
應用程序的多少、好壞是決定Linux繼續生存、發展的關鍵。Linux開放源代碼，這對開發高質量的應用程序很有利。而且Linux是國際的，可以隨時跟上世界技術發展的步伐，也使我國的眾多應用程序不必受制於某個公司。也就是說，我們要在Linux上開發出大量的應用程序，要讓用戶真正使用Linux及其應用程序來解決工作中的實際問題。
現在國內越來越多的應用程序開發商開始關注Linux，並開發出更多、更好的在Linux上運行的應用軟件。例如，寧波比特軟件有限公司開發了基於Linux的工作流軟件，清華文通公司也開發出了基於Linux文通辦公自動化軟件，南北天地、用友的財務軟件已能在Linux上運行，同時基於Linux的字處理軟件也出現了……
辦公自動化是中小企業解決方案的基礎，是解決Linux應用程序的突破口。Linux的應用程序應從辦公自動化做起。
辦公自動化主要包括：字處理軟件、工作流、Web和搜索引擎、電子郵件、數據庫。
字處理軟件
字處理軟件用於文字處理、制表，是辦公自動化桌面系統的基礎和關鍵。
Linux與微軟在桌面系統的競爭能否勝利，關鍵之一就在於Linux是否有好的字處理軟件。
目前，直接在Linux上運行的類似Office的軟件有:聯想推出與微軟Office兼容的幸福Office；紅旗中文2000桌面辦公平台——RedOffice，由辦公套件、因特網套件、多媒體套件、信息服務四部分組成；Star Office Sun公司已於2000年8月開放源代碼。它與微軟Office兼容。現在我國有公司正在開發漢化版本；Word Perfect是Corel公司的產品，據了解正在進行漢化，但是沒有開放源代碼；Redhat Linux推出與微軟Office兼容的字處理軟件Do Office；韓軟推出了文傑字處理軟件。
鑒於目前微軟在字處理軟件市場上占極大分額，基於Linux的Office軟件應注意和微軟的Office兼容。同時，在Linux上的字處理軟件有很多種，競爭有利於技術發展，但界面應有標准，以利於用戶使用。
工作流軟件
工作流軟件是辦公自動化和電子商務的關鍵、核心軟件。
辦公自動化系統的實現需要大范圍的數據和眾人的協商，例如一個文件，就包括文件的起草、審核、會簽、批准、發布等程序。這就存在一個流程。工作流(Workflow)是指業務在點到點(對應於人與人或某項工作到某項工作)之間的流動和處理。一般的公文流轉都是采用工作流的方式來運作的。例如文件傳閱、收發文、審批、請示報告。這些支持業務流動、應用通信等特性的工作方式稱為工作流特色。
在這方面，Lotus的Domino已有for Linux的版本。國內的寧波比特軟件有限公司也正在編寫高水平的有自主知識產權的企業級的專業工作流軟件，以解決應用軟件的核心、關鍵問題。
電子郵件
好的電子郵件應具有高可靠性、高可用性、可擴展性和可管理性、安全性(和垃極郵件的防范)。
在Linux上常用的是Sendmail郵件系統，它采用的是集中式的體系結構，其用戶信息存放在/etc/Passwd文件中。當用戶數量很大時，認證效率就大大降低。其次，其郵件存放在/var/mail目錄下，每個人的郵件就是一個文件。郵件數目多時，文件數目就多，當同一級目錄下的文件超過一定數目時，文件系統的運行效率就會大大降低。第三,由於NFS缺乏文件鎖定機制，在使用傳統的用戶郵件存儲格式Mailbox，使用NFS共享存儲空間時，所有的郵件都保存在同一個文件中，因此進行郵件操作就必須加鎖，以保證沒有訪問沖突，這又使得它不適合NFS存儲方式。第四，由於每一個用戶的多種郵件都位於同一個文件中，如果用戶取信過程中出現網絡異常，則很容易造成郵箱死鎖。
現在還出現了一種點對點的電子郵件，即電子郵件繞過服務器直接傳輸到另一方。
世紀永聯的For-Mail郵件系統采用分布式體系結構，可以實現負載動態均衡，還可通過增加機器提高系統支持的用戶容量和反應速度。它不僅提供了WebMail功能，而且還提供POP、SMTP、IMAP4、WAP等收發支持。
萬博網與美國朗訊科技聯合開發出萬博Eyemail視聽郵件系統，第一次將音頻、視頻郵件推向了實用。視聽郵件系統代表了當前電子郵件的發展方向。
北大方正科技發展有限公司推出的革命性的Mail2G是基於TCP/IP基礎網絡協議。在Mail2G模式中，發信方發出的每一封郵件都會占據它自己的郵箱空間，而對收信方的郵箱不會有任何影響，從根本上解決了垃極郵件、郵件炸彈的難題。該軟件還支持斷點續傳，並加入了多點對多點的傳輸技術和獨特的掛號信功能。其不足之處是現在只實現了單向兼容。
數據庫
Linux環境下的數據庫可分為自由軟件類數據庫和商業類數據庫兩類。自由軟件類數據庫主要有PostgreeSQL、mysql，商業類數據庫Oracle、DB2、Sybase、Informix等數據庫都支持Linux。
