最近從Windows遷到Ubuntu,其中很多軟件都不一樣了。
一一更新,發現以很多軟件的功能不比windows差,甚至更強,但是要熟悉起來要花不少的時間。在安裝的過程,google了很多文章介紹,但是經常是一些過期的文章,針對過期的版本,或者過期的操作系統,看了以後安裝了,結果反而是不對的。非常的遺憾。
所以找資料的時候,要看好是版本,系統,或者有沒有更全面的文章。
我的系統是Ubuntu 7.10
先列一下我安裝的軟件列表:
綜合性的軟件有以下的:
openoffice.org
GIMP
DIA
pidgin
emacs
mysql
pdfedit
acrobat reader
綜合性軟件大部分安裝都很順利,其中pidgin好象是自己編譯的。其它都是
sudo apt-get install xxxx
生物專業的軟件:
bioperl
emboss(Jemboss)
staden package
blast
clustal
R
texLive2007(kile)
emacs
其中texLive是以前下的,在windows下安裝用的是同一張光盤。
要注意的是emboss和staden二個軟件。
其中emboss的安裝,因為需要Jemboss所以下了以後在jemboss的文件夾裡有安裝文件的。在EMBOSS-5.0.0/jemboss/utils下有一個叫install-jemboss-server.sh的文件,安裝一步一步下來就行了。每一步的參考在jemboss的上有介紹。
staden其實是不用安裝的。只要下載了就可以直接運行,不過要設置運行的時選項。