自由軟件都可以在SunOS以及類似的主流的BSD上系統運行。*BSD用戶一般情況下可以無需作任何修改即可編譯那些為其他類unix系統編寫的軟件。
另外，每一個BSD項目都使用ports系統來管理軟件，使得編譯移植軟件庫中軟件極其簡單。
FreeBSD
當前移植軟件庫中有13000多個應用程序可以下載和安裝。在i386和AMD64平台，有linux模擬層能夠運行決多數linux的應用軟件。AMD64和安騰平台，擁有一個兼容層來運行32位的FreeBSD二進制程序。
NetBSD
linux模擬層可以運行大部分i386平台linux的應用程序，並且大部分SunOS4應用程序能在SPARC工作站上運行。
OpenBSD：
當前移植軟件庫中大概有400多應用程序可以下載與使用。linux模擬層運行大部分i386平台的linux程序，大部分SunOS4應用程序能在SPARC工作站上運行。用戶只需很少的努力，NetBSD與OpenBSD就能夠運行FreeBSD的移植軟件庫的程序。他們很少的移植程序也說明了這一點。
大部分公司把它們的工作遷移到PC unix平台時最先選擇linux，這是事實。幸運地是，BSD的linux模擬層能夠運行這些程序，比如Acrobat,StarOffice, Mathematica,WordPerfect, Quake, Intel ICC compiler, Compaq's Alpha compiler 等。即使出了問題，也容易解決。
作為一個有歷史意義的注記：帶有java支持的第一版Netscape Navigator是linux版的。不過，現在你可以使用帶有本地版java插件的本地版Mozilla的，那都可以很方便地從移植軟件庫編譯！
