下面列出了 Red Hat Linux 的主要系統目錄及其簡單描述。
/bin/ — 用來貯存用戶命令。目錄 /usr/bin 也被用來貯存用戶命令。
/sbin/ — 許多系統命令（例如 shutdown）的貯存位置。目錄 /usr/sbin 中也包括了許多系統命令。
/root/ — 根用戶（超級用戶）的主目錄。
/mnt/ — 該目錄中通常包括系統引導後被掛載的文件系統的掛載點。譬如，默認的光盤掛載點是 /mnt/cdrom/ .
/boot/ — 包括內核和其它系統啟動期間使用的文件。
/lost+found/ — 被 fsck 用來放置零散文件（沒有名稱的文件）。
/lib/ — 包含許多被 /bin/ 和 /sbin/ 中的程序使用的庫文件。目錄 /usr/lib/ 中含有更多用於用戶程序的庫文件。
/dev/ — 貯存設備文件。
/etc/ — 包含許多配置文件和目錄。
/var/ — 用於貯存 variable （或不斷改變的）文件，例如日志文件和打印機假脫機文件。
/usr/ — 包括與系統用戶直接有關的文件和目錄，例如應用程序及支持它們的庫文件。
/proc/ — 一個虛擬的文件系統（不是實際貯存在磁盤上的），它包括被某些程序使用的系統信息。
/initrd/ — 用來在計算機啟動時掛載 initrd.img 映像文件的目錄以及載入所需設備模塊的目錄。
警告:不要 刪除 /initrd/ 目錄。如果你刪除了該目錄後再重新引導 Red Hat Linux 時，你將無法引導你的計算機。
/tmp/ — 用戶和程序的臨時目錄。 /tmp 給予所有系統用戶讀寫權。
/home/ — 用戶主目錄的默認位置。
/opt/ — 可選文件和程序的貯存目錄。該目錄主要被第三方開發者用來簡易地安裝和卸裝他們的軟件包。
