Ubuntu Linux的文件結構與Windows的文件結構不同，Windows將硬盤分成Ｃ、Ｄ、Ｅ、Ｆ等盤，也就是分成這些分區。
而Linux操作系統不是把硬盤分 成這樣的分區，它有一個根目錄，用/表示，一個目錄就相當於一個文件夾，根目錄就相當於Linux系統的總的文件夾。在這個根目錄下面，又分為/bin /boot /dev /etc /home /initrd /lib /media /mnt /opt /root /sbin /usr /var /tem 等等典型的目錄。其他的目錄可以單獨分區，也可以不單獨分區，只保留一個跟目錄分區，這樣，這些目錄將會自動建立在根目錄下。下面列出了Linux下一些 主要目錄的功用：
/bin 二進制可執行命令
/dev 設備特殊文件
/etc 系統管理和配置文件
/etc/rc.d 啟動的配置文件和腳本
/home 用戶主目錄的基點，比如用戶user的主目錄就是/home/user，可以用~user表示
/lib 標准程序設計庫，又叫動態鏈接共享庫，作用類似Windows裡的.dll文件
/sbin 系統管理命令，這裡存放的是系統管理員使用的管理程序
/tmp 公用的臨時文件存儲點
/root 系統管理員的主目錄（呵呵，特權階級）
/mnt 系統提供這個目錄是讓用戶臨時掛載其他的文件系統。
/lost+found 這個目錄平時是空的，系統非正常關機而留下“無家可歸”的文件（Windows下叫什麼.chk）就在這裡
/proc 虛擬的目錄，是系統內存的映射。可直接訪問這個目錄來獲取系統信息。
/var 某些大文件的溢出區，比方說各種服務的日志文件
/usr 最龐大的目錄，要用到的應用程序和文件幾乎都在這個目錄。其中包含：
/usr/X11R6 存放X window的目錄
/usr/bin 眾多的應用程序
/usr/sbin 超級用戶的一些管理程序
/usr/doc linux文檔
/usr/include linux下開發和編譯應用程序所需要的頭文件
/usr/lib 常用的動態鏈接庫和軟件包的配置文件
/usr/man 幫助文檔
/usr/src 源代碼，linux內核的源代碼就放在/usr/src/linux裡
/usr/local/bin 本地增加的命令
/usr/local/lib 本地增加的庫
在以上目錄中，只有/home下，你自己的用戶目錄，對於普通用戶才具有完全的權限，你下載東西、你的配置文件都在這個目錄下，這是你最常用的目錄。其他目錄裡，你如果需要刪除或者修改文件，則必須具有管理員權限，否則不能修改。這樣就可以很大程度上防止病毒修改你的系統文件。
而在安裝系統 的時候，如果將/home單獨分區，那麼你下次重裝系統的時候，所有的個人配置文件都會保留，例如你ＱＱ裡的聊天記錄、你浏覽器裡的書簽收藏等等你所有的個人設置都會仍然保留。
