內核本身也可以看成是一個“程序”。為什麼內核需要配置文件？內核需要了解系統中用戶和組的列表，進而管理文件權限（即根據權限判定特定用戶 （UNIX_USERS）是否可以打開某個文件）。注意，這些文件不是明確地由程序讀取的，而是由系統庫所提供的一個函數讀取，並被內核使用。例如，程序 需要某個用戶的（加密過的）密碼時不應該打開 /etc/passwd 文件。相反，程序應該調用系統庫的 getpw() 函數。這種函數也被稱為系統調用。打開 /etc/passwd 文件和之後查找那個被請求的用戶的密碼都是由內核（通過系統庫）決定的。
除非另行指定，Red Hat Linux 系統中大多數配置文件都在 /etc 目錄中。
