系統命令要獨占地控制系統，並讓一切正常工作。所有如 login（完成控制台用戶身份驗證階段）或 bash（提供用戶和計算機之間交互）之類的程序都是系統命令。因此，和它們有關的文件也特別重要。這一類別中有下列令用戶和管理員感興趣的文件。
/etc/lilo.conf
包含系統的缺省引導命令行參數，還有啟動時使用的不同映象。您在 LILO 引導提示的時候按 Tab 鍵就可以看到這個列表。
/etc/logrotate.conf
維護 /var/log 目錄中的日志文件。
/etc/identd.conf
identd 是一個服務器，它按照 RFC 1413 文檔中指定的方式實現 TCP/IP 提議的標准 IDENT 用戶身份識別協議。identd 的操作原理是查找特定 TCP/IP 連接並返回擁有此連接的進程的用戶名。作為選擇，它也可以返回其它信息，而不是用戶名。請參閱 identd 聯機幫助頁。
/etc/ld.so.conf
“動態鏈接程序”（Dynamic Linker）的配置。
/etc/inittab
按年代來講，這是 UNIX 中第一個配置文件。在一台 UNIX 機器打開之後啟動的第一個程序是 init，它知道該啟動什麼，這是由於 inittab 的存在。在運行級別改變時，init 讀取 inittab，然後控制主進程的啟動。
/etc/termcap
一個數據庫，包含所有可能的終端類型以及這些終端的性能。
