命令解釋程序shell是與用戶關系最密切的應用程序，用戶主要通過shell使用系統。在每次登錄系統之後，就啟動了一個與用戶交互的shell，這個shell將給出一個提示符等待用戶輸入，（sh為 “$” ，csh為 “%” ，如果是使用root用戶，登錄提示符將是 “#” ），然後對用戶的輸入進行解釋執行。
FreeBSD的基本系統中可以使用的shell有兩個：sh和csh。這兩個基本shell的風格不太相同，不同的使用者常常會根據喜好來在兩者之間進行選擇。當然當前有更好的shell程序可供使用者選擇，這些後續的 shell均是根據sh或csh的風格進一步發展出的，因此可以說在shell中，也有兩種風格，需要使用者根據自己的使用習慣進行選擇。
對於管理員來將，要為使用不同shell的用戶都設置好基本的環境，就必須了解這兩種風格的shell設置方式。系統登錄時，sh將首先執行/etc/profile文件，為每個用戶設置最基本的環境，而csh將使用 /etc/csh.cshrc，csh.login和csh.logout作為系統csh 資源文件。執行了系統級別的登錄文件之後，每個用戶的shell就在該用戶的主目錄下尋找該用戶個人的資源文件：sh使用.profile文件，csh使用.login和.cshrc文件。這些資源文件均使用相應的shell語言，/etc/profile和個人目錄下的.profile使用sh風格的控制語言，/etc/cshrc和個人目錄下的.login、.cshrc使用csh 風格的控制語言。系統管理員可以改動這些資源文件，為用戶提供一個最方便的使用環境。當然，系統管理員沒有必要直接去修改個人主目錄下的資源文件，這些文件應該由用戶自己管理，但是系統管理員可以在生成帳號時為用戶產生缺省的資源文件，以減輕用戶設置資源文件的麻煩。adduser命令缺省使用/usr/share/skel下的文件為用戶提供各種資源文件的缺省設置，這個目錄下除了可以放入shell的資源文件之外，還可以放入其他應用程序的資源文件。由於這些資源文件都是以點開頭的隱藏文件，為了表示清楚，在skel目錄下使用了一種轉換方式，如使用dot.profile 作為.profile的模板。
# ls /usr/share/skel
dot.cshrc dot.mail_aliases dot.rhosts
dot.login dot.mailrc dot.shrc
dot.login_conf dot.profile
在/usr/share/skel中為用戶設置的缺省配置文件，在用戶生成之後，就不會對用戶產生影響了。因此對系統登錄文件進行修改更有效和直接。對於sh風格的用戶，可以更改/etc/profile文件，對csh應更改 /etc/csh.cshrc文件。在這些文件中可以改動shell使用的環境變量，這樣來改變shell的行為方式，或者執行一系列自動操作，完成一些用戶登錄時需要自動執行的任務。
常用的環境變量
EDITOR 設置用戶常用的編輯器，很多程序查看這個變量來啟動具體的編輯器，可以 根據系統的情況更改
HOME 用戶的主目錄的名字，這個變量由login程序設置，一般不需要更改DISPLAYX 使用這個環境變量來標識具體的顯示位置，格式為“計算機名字：X服務 器序號.顯示屏序號” ，例如：xt1:0.0，它不需要在資源文件中進行定義
LANG 系統使用的語言，用於系統的本地化，缺省為 “C” ，具體的設置可以查看 /usr/share/locale 目錄，那裡定義了不同的語言，可以將其設置為zh_CN.EUC來使得一些軟件使用中文字符。
MAIL 用戶mail文件的位置，也不需要改動PATH 使用冒號分隔的一系列路徑，系統用它來查找具體可執行程序，因此這個變量非常重要，可以根據具體的情況改動其值。為了安全的原因，不要將當前目錄作為執行程序的搜尋路徑，尤其對於root用戶。這樣在當前目錄下啟動程序，需要加上路徑，例如啟動當前目錄下的a.out 程序，輸入 “./a.out” 。
MANPATH 使用冒號分隔的一系列路徑，系統用它來查找具體命令的在線手冊，設置方法與PATH相同。
PS1sh 風格的shell使用這個變量的值作為提示符，缺省值為 “$”（root為 “#” ）。更現代的sh就增強了提示符的靈活性，可以在提示符中加入當前目錄、用戶名、機器名，命令的序號等。
PS2sh 風格的shell使用這個變量的值作為後續提示符，提示命令還沒有完全輸入，缺省為 “>“TERM 終端的類型，對於需要全屏操作的程序，非常重要。有時要根據情況對設置進行調整。
TZ 時區設置，具體的時區信息位於/usr/share/zoneinfo目錄下，需要設置為適合本地 時區的標准值
可以將用戶的shell設置為特殊的應用程序，來達到對特殊用戶進行限制的目的。例如，僅僅給予用戶一個電子郵件信箱，但不想給他終端使用權，可以將用戶的shell更改為/bin/true或者其他立即退出的程序。為了安全起見，用戶shell應該是一個不存在漏洞的二進制程序，最好不要使用解釋性語言腳本作為登錄shell。由於系統認可的shell 程序是在/etc/shells文件中列出的程序，將特殊用戶的shell設置為特殊的應用程序，但這些應用程序沒有列入shells文件，那麼這個用戶就會被一些應用程序區分出與普通用戶的差異，從而拒絕提供服務。例如ftp服務器程序ftpd，通過檢查用戶的shell是不是標准shell，來區分這個用戶是普通用戶還是用於特定目的的用戶。
注意，不能輕易更改root用戶的shell，因為這可能會造成root無法正常登錄，而使得無法正常執行系統維護。即使是將root的shell更改為其他更新、更強功能的標准shell，例如bash或tcsh，也是不應該。雖然這些shell也是非常成熟的shell程序，仍然不應該使用它們作為root的shell。主要原因是這些 shell一般沒有被安裝到根分區中，那麼當系統進入單用戶狀態時就會發生問題。另外這些shell可能會由於進行版本升級等原因，而偶然形成故障，造成root無法正確登錄。此外，由於這些非標准shell不一定來自於系統的安裝盤，因此也存在對shell來源的安全信任問題，必須保證這些shell不是經攻擊者更改過的版本。如果要使用它們 shell提供的方便特性，可以在系統登錄之後再使用全路徑執行它們。
配置用戶shell
事實上sh與csh，並不是普通用戶的最佳選擇，因為這兩個shell在易用性方面做的不夠好，例如命令行編輯功能不強、不能利用熱鍵重復執行命令等。較新的shell，如bash和tcsh都具有這些方便用戶使用的功能，但必須安裝了這些shell程序之後，才能更改普通用戶的shell設置以使用這些shell程序。更改用戶的shell 可以使用pw、vipw或chsh。
這兩個shell分別遵照sh和csh的風格，因此喜好csh風格的可以選擇tcsh，而喜歡sh風格的選擇 bash。除了這兩種shell之外，還有ksh、zsh等shell可供選擇。如果對兩種shell沒有偏好，可以選擇bash，它是一個GNU軟件，比標准sh功能強大的多。
使用了這兩些增強型shell之後，用戶就可以使用shell提供的命令行編輯功能。按照習慣的不同，可以選擇vi風格的編輯方式或emacs風格的方式，缺省為emacs方式，這種方式使用方向鍵來回溯執行過的命令，並進行修改，而vi風格使用字母命令作編輯鍵，例如使用h、j、k、l四個鍵來移動光標，vi風格的好處是不使用基本鍵盤之外的控制鍵，因而可以適用於任何終端設備，並且進行編輯時手不需離開基本鍵盤，熟練操作之後最為快捷。emacs風格比起vi風格更適合從個人計算機轉向Unix的使用者的習慣。bash, ksh ,zsh下使用下面的命令在emacs 風格和vi風格切換：
bash$ set -o emacs
bash$ set -o vi
tcsh中使用不同的命令：
% bind emacs
% bind vi
還可以為常用的命令設置別名，簡化用戶輸入，例如：
bash$ alias ec=”echo This is a alias”
bash$ ec
This is a alias
shell用於方便用戶操作的另一項能力是自動補全命令或文件名的功能，因為FreeBSD下的文件名可能很長，將它們全部輸入比較麻煩。事實上可以輸入部分名字，然後按Tab鍵（在vi風格下是連續兩次按Esc鍵），shell 將自動補全文件名的剩余部分。如果已經輸入的這部分名字不能確定具體的命令或文件，那麼shell只將能確定的部分補上，
然後響鈴通知使用者繼續輸入以明確具體的文件。
事實上即使在基本的sh或csh下，也可以使用 “*” 等特殊字符，用模式匹配的方式來簡化輸入。
bash$ cd /usr/loca*
bash$ pwd
/usr/local
Unix中的多數程序都具備模式匹配的處理能力，而shell的模式匹配功能最為常用。
shell可以使用這些特殊模式來配置多個文件，達到簡化操作的目的。如果要熟練掌握Unix，必須掌握模式匹配。
當試圖在bash下輸入漢字的時候，除了必須設置終端屬性能接受8位字符之外（執行stty pass8命令），還需要設置bash的輸入輸出轉換，可以在登錄腳本.profile文件中 包括以下設置：
bind 'set convert-meta off'
bind 'set meta-flag on'
bind 'set output-meta on'
